Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA4

Msmo1, Methylsterol monooxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msmo1Q9CRA4 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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