Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms