Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ykt6Q9CQW1 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ykt6Q9CQW1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms