Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
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