Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ccer1Q9CQL2 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccer1Q9CQL2 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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