Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nudt21Q9CQF3 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms