Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RTRAFQ9CQE8 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.8 ms