Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Rab5aQ9CQD1 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Rab5aQ9CQD1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab5aQ9CQD1 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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