Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9CQC3 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CQC3 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CQC3 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q9CQC3 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CQC3 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms