Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Rpa3Q9CQ71 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Rpa3Q9CQ71 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Rpa3Q9CQ71 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Rpa3Q9CQ71 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
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Rpa3Q9CQ71 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpa3Q9CQ71 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms