Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg3Q9CPX6 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg3Q9CPX6 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms