Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atp1b4Q99ME6 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp1b4Q99ME6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms