Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm2d1Q99MB3 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
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