Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms