Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pagr1aQ99L02 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms