Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hps4Q99KG7 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms