Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmed9Q99KF1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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