Protein–RNA interactions for Protein: Q99J38

Ttc30a1, Tetratricopeptide repeat protein 30A1, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc30a1Q99J38 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc30a1Q99J38 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms