Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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