Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb6Q922F4 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms