Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Csnk1a1-208ENSMUST00000167187 1222 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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