Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Vmn1r200Q8R281 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Vmn1r200Q8R281 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Vmn1r200Q8R281 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Vmn1r200Q8R281 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
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Vmn1r200Q8R281 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Vmn1r200Q8R281 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vmn1r200Q8R281 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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Vmn1r200Q8R281 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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Vmn1r200Q8R281 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Vmn1r200Q8R281 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Vmn1r200Q8R281 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Vmn1r200Q8R281 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vmn1r200Q8R281 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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