Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf39Q8K2Z2 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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