Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q9

Shtn1, Shootin-1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shtn1Q8K2Q9 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Shtn1Q8K2Q9 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms