Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fcho1Q8K285 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fcho1Q8K285 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms