Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Afg3l2Q8JZQ2 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Afg3l2Q8JZQ2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms