Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Rab11fip3Q8CHD8 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab11fip3Q8CHD8 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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