Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI0

Nedd4l, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4lQ8CFI0 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nedd4lQ8CFI0 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nedd4lQ8CFI0 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nedd4lQ8CFI0 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nedd4lQ8CFI0 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nedd4lQ8CFI0 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nedd4lQ8CFI0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nedd4lQ8CFI0 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nedd4lQ8CFI0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nedd4lQ8CFI0 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nedd4lQ8CFI0 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nedd4lQ8CFI0 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nedd4lQ8CFI0 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nedd4lQ8CFI0 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nedd4lQ8CFI0 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.3 ms