Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Hpf1Q8CFE2 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Hpf1Q8CFE2 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Hpf1Q8CFE2 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Hpf1Q8CFE2 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Hpf1Q8CFE2 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Hpf1Q8CFE2 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms