Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Ercc8Q8CFD5 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ercc8Q8CFD5 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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