Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx8Q8CFD4 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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