Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms