Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pramef8Q8CE24 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef8Q8CE24 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef8Q8CE24 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef8Q8CE24 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef8Q8CE24 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef8Q8CE24 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef8Q8CE24 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef8Q8CE24 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef8Q8CE24 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef8Q8CE24 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef8Q8CE24 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef8Q8CE24 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef8Q8CE24 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef8Q8CE24 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef8Q8CE24 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef8Q8CE24 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef8Q8CE24 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef8Q8CE24 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef8Q8CE24 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef8Q8CE24 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef8Q8CE24 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef8Q8CE24 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef8Q8CE24 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef8Q8CE24 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef8Q8CE24 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef8Q8CE24 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef8Q8CE24 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef8Q8CE24 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef8Q8CE24 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef8Q8CE24 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef8Q8CE24 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef8Q8CE24 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef8Q8CE24 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef8Q8CE24 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef8Q8CE24 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef8Q8CE24 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef8Q8CE24 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef8Q8CE24 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef8Q8CE24 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef8Q8CE24 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef8Q8CE24 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef8Q8CE24 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef8Q8CE24 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef8Q8CE24 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pramef8Q8CE24 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef8Q8CE24 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef8Q8CE24 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef8Q8CE24 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef8Q8CE24 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef8Q8CE24 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef8Q8CE24 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef8Q8CE24 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef8Q8CE24 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef8Q8CE24 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef8Q8CE24 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pramef8Q8CE24 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms