Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

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Length 565 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc17Q8CE13 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc17Q8CE13 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc17Q8CE13 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc17Q8CE13 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc17Q8CE13 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc17Q8CE13 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc17Q8CE13 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc17Q8CE13 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc17Q8CE13 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc17Q8CE13 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc17Q8CE13 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Ccdc17Q8CE13 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Ccdc17Q8CE13 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
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Ccdc17Q8CE13 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Ccdc17Q8CE13 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Ccdc17Q8CE13 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc17Q8CE13 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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