Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

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Length 866 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc178Q8CDV0 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc178Q8CDV0 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc178Q8CDV0 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc178Q8CDV0 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc178Q8CDV0 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc178Q8CDV0 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc178Q8CDV0 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc178Q8CDV0 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc178Q8CDV0 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc178Q8CDV0 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc178Q8CDV0 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc178Q8CDV0 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc178Q8CDV0 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc178Q8CDV0 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc178Q8CDV0 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc178Q8CDV0 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc178Q8CDV0 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc178Q8CDV0 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ccdc178Q8CDV0 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc178Q8CDV0 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc178Q8CDV0 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc178Q8CDV0 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc178Q8CDV0 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc178Q8CDV0 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc178Q8CDV0 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc178Q8CDV0 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc178Q8CDV0 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc178Q8CDV0 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc178Q8CDV0 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc178Q8CDV0 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc178Q8CDV0 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc178Q8CDV0 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc178Q8CDV0 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc178Q8CDV0 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc178Q8CDV0 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc178Q8CDV0 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc178Q8CDV0 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc178Q8CDV0 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc178Q8CDV0 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc178Q8CDV0 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ccdc178Q8CDV0 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc178Q8CDV0 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc178Q8CDV0 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc178Q8CDV0 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ccdc178Q8CDV0 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc178Q8CDV0 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ccdc178Q8CDV0 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ccdc178Q8CDV0 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ccdc178Q8CDV0 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ccdc178Q8CDV0 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Ccdc178Q8CDV0 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc178Q8CDV0 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Ccdc178Q8CDV0 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc178Q8CDV0 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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