Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ccdc38Q8CDN8 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc38Q8CDN8 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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