Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ephb1Q8CBF3 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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