Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6J9

Nlrp4b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4bQ8C6J9 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nlrp4bQ8C6J9 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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