Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ubqln3Q8C5U9 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms