Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx16Q8C080 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms