Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm4aQ8BW72 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kdm4aQ8BW72 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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