Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIF2

Rbfox3, RNA binding protein fox-1 homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbfox3Q8BIF2 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms