Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Liat1Q810M6 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms