Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zbed4Q80WQ9 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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