Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ube2q1Q7TSS2 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms