Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms