Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nphp3Q7TNH6 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms