Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Sys1Q78S06 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Sys1Q78S06 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Sys1Q78S06 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Sys1Q78S06 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sys1Q78S06 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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