Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rph3alQ768S4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms