Protein–RNA interactions for Protein: Q71M36

Cspg5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspg5Q71M36 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cspg5Q71M36 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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